アップデートが正常に行われた場合は、作成・編集中のマニュアルの未保存データは消えません。
ただし、正常にアップデートが完了しなかった場合に、アプリからログアウトされることがあります。
再ログインすることでアップデートは完了しますが、ログアウトによって保存前のデータは破棄されます。
関連：「データを正常に読み込めませんでした。解決のために再ログインしてください」が表示されました
https://help.teachme.jp/hc/ja/articles/14571088890521
アプリのアップデートを行う前に、端末内のデータをサーバーに保存することを推奨します。
関連：マニュアルを下書き保存する（モバイルアプリ）
https://teachme.jp/8/manuals/753015
関連：モバイルアプリの「未同期」について教えてください
https://help.teachme.jp/hc/ja/articles/12095601263769