以下の方法で効率的に管理が可能です。
１．すべてのユーザーが登録されているチームを作成する
▼チームを作成、編集する（Webブラウザ版）
https://teachme.jp/8/manuals/4891885
２．すべてのフォルダに作成したチームを追加する
▼フォルダにチームを追加する（Webブラウザ版）
https://teachme.jp/8/manuals/4890041
その後、利用者の削除や追加が生じた際に１.で作成したチームにユーザーを追加/削除することで、すべてのフォルダに権限設定がなされます。